Сергей Михайлович Сироткин родился в 1979 году в г. Троицке Московской области. В 1995 г. окончил Музыкальную школу по классу фортепиано. В 1999 г. закончил дирижёрско-хоровое отделение Государственного музыкального училища имени Гнесиных. В 1999-2004 гг. обучался в Российской академии музыки имени Гнесиных по специальности «Композиция» (класс профессора А. И. Головина). В 2006 г. закончил ассистентуру-стажировку в РАМ имени Гнесиных. В 2007-2012 гг. С. М. Сироткин обучался в РАМ имени Гнесиных по специальности «Орган» (руководитель – профессор Александр Владимирович Фисейский). С июля 2012 по июль 2013 года учился в магистратуре РАМ имени Гнесиных (класс профессора Александра Владимировича Фисейского).
Как органист, клавесинист, исполнитель на клавикорде и фисгармонии, а также как композитор С. М. Сироткин регулярно участвует в Международных симпозиумах «Орган в XXI веке» и в Международных фестивалях «Музыкальное приношение Иоганну Себастьяну Баху» в РАМ им. Гнесиных.
С февраля 2012 года С. М. Сироткин преподает курс «Нотация в старинной органной музыке» у студентов-органистов, обучающихся по программе бакалавриата. В дальнейшем сфера его педагогической деятельности расширилась за счет дисциплин «Источниковедение и интерпретация музыки Барокко», «Генерал-бас», «Изучение симфонических партитур с участием органа» и др.
Изданные собрания композиций С. М. Сироткина: