Окончила историко-теоретико-композиторский факультет и аспирантуру РАМ имени Гнесиных (класс профессора М. А. Енговатовой).
В 2000 году защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата искусствоведения «Волочёбные (христославные) песни восточных славян» (научный руководитель – профессор М. А. Енговатова).
Педагогическую деятельность начала в РАМ имени Гнесиных в 2001 году. В настоящее время – ведущий специалист Музыкально-этнографического Центра (МЭЦ) имени Е. В. Гиппиуса РАМ имени Гнесиных. Основные профессиональные интересы связаны с изучением народной музыки, в частности – с исследованием западнорусских музыкальных традиций. «География» музыкально-фольклорных экспедиций С. А. Латышевой представлена значительным числом областей России (Смоленская, Брянская, Псковская, Тверская, Орловская, Калужская, Белгородская области) и сопредельными территориями Белоруссии (Витебская, Могилёвская области). Участник научных проектов РФФИ и РГНФ. С 2013 года – один из участников проекта создания «Единого электронного каталога объектов нематериального культурного наследия народов РФ». Член Оргкомитета Международного фольклорного фестиваля «Майские ассамблеи» (РАМ имени Гнесиных). Среди основных научных публикаций С. А. Латышевой – многотомное научное издание «Смоленский музыкально-этнографический сборник» (член авторского коллектива).
С 2014 по 2018 гг. преподавала на кафедре музыкально-прикладного искусства, с 2018 г. – на кафедре этномузыкологии.