Окончила историко-теоретико-композиторский факультет и аспирантуру РАМ им. Гнесиных (класс профессора М.А.Енговатовой).
В 2000 году защитила диссертацию на соискание учёной степени кандидата искусствоведения «Волочёбные (христославные) песни восточных славян» (научный руководитель – профессор М.А.Енговатова).
Педагогическую деятельность начала в РАМ им. Гнесиных в 2001 году.
В настоящее время – ведущий специалист Музыкально-этнографического Центра (МЭЦ) им. Е.В. Гиппиуса РАМ им. Гнесиных.
Основные профессиональные интересы связаны с изучением народной музыки, в частности – с исследованием западнорусских музыкальных традиций. «География» музыкально-фольклорных экспедиций С.А.Латышевой представлена значительным числом областей России (Смоленская, Брянская, Псковская, Тверская, Орловская, Калужская, Белгородская области) и сопредельными территориями Белоруссии (Витебская, Могилёвская области).
Участник научных проектов РФФИ и РГНФ. С 2013 года – один из участников проекта создания «Единого электронного каталога объектов нематериального культурного наследия народов РФ». Член Оргкомитета Международного фольклорного фестиваля «Майские ассамблеи» (РАМ им. Гнесиных). Среди основных научных публикаций С.А.Латышевой – многотомное научное издание «Смоленский музыкально-этнографический сборник» (член авторского коллектива).
С 2014 по 2018 гг. преподавала на кафедре музыкально-прикладного искусства, с 2018 г. – на кафедре этномузыкологии.